WordPressでは勝手にHTMLのコメントを整形してしまうので、この整形を削除する方法です。
functions.phpで削除する
functions.phpに追記するだけで、整形を削除出来ます。
remove_filter('the_content', 'wpautop');
と、追記すると整形を削除出来ます。
しかし、この方法だと全てに影響してしまうので、影響する箇所を限定します。
出力する際に削除する
出力する際に記述することで、削除する箇所を限定することが出来ます。
remove_filter('the_content', 'wpautop'); the_content();
と、『the_content()』を出力する前に記述してあげる事で、コメントの整形を削除出来ます。